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SoSe 14: Modelling and Simulation in Systems Pharmacology

Christof Schütte, Max von Kleist

Information for students

Zielgruppe: Studierende der Bioinformatik sowie verwandter Fächer ab dem 5. Semester. Zugehörig zu Praxismodul "Rechnergestützte System-Biologie". Das Seminarangegebot richtet sich auch an interessierte Bachelorstudenten der Fachrichtung Mathematik/Bioinformatik. Prüfungsleistung: Semsterbegleitende Projektarbeit eines Themenkomplexes mit benotetem Vortrag und schriftlicher Ausarbeitung. Perspektiven:Ergänzende Veranstaltungen im Bereich Scientific Computing mit Möglichkeit zur Abschlussarbeit in verschiedene Richtungen. close

Additional information / Pre-requisites

Grundwissen in den biochemischen/medizinischen oder den mathematischen Grundlagen (Differentialgleichungen, Numerik, Statistik). Programmierkenntnisse. Hilfreich: Vorlesung "Numerical Methods for Systems Biology" (Deuflhard/Röblitz) close

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"System-Pharmakologie" beschreibt ein neues Feld, das die Brücke zwischen dem molekularen Verständnis zellulärer Prozesse (System-Biologie), der Pharmazie und der Medizin schlägt, indem es sich mit der Steuerung verschiedener Krankheitsprozesse mittels Therapie befasst. In dem Seminar befassen wir uns mit der Beschreibung dieses Zusammenspiels mit Hilfe von mathematischen Modellen. In dem Seminar soll zunächst Grundwissen über Modellierungsansätze vermittelt werden. Im weiteren Verlauf geht es um die mathematische Modellierung und ihre konkrete numerische Umsetzung anhand ausgewählter Fallstudien in einem der folgenden Themengebiete:

Pharmakokinetische Modellierung
Modellierung der Wirkstoff-Zielprotein Interaktion
Krankheitsmodelle und Wirkstoffeffekte
Alternative Numerische Verfahren
Methoden zur Therapieplanung

Die Prüfungsleistung besteht in der Regel aus der Aufarbeitung eines Themas anhand vorgegebener Literatur, Implementierung oder theoretischer Behandlung einer konkreten Problemstellung, Dokumentation der Ergebnisse in einer schriftlichen Ausarbeitung und Vorstellung der Ergebnisse in einem Vortrag. close