Behandelt werden Fragen der Homologie in der Molekularbiologie, wobei das Thema Alignment von Sequenzen mit mikrostrukturellen Mutationen intensiv theoretisch und praktisch (Einführung in Computerprogramme) bearbeitet wird. Die Studierenden arbeiten dazu mit unterschiedlichen Methoden und Programmen an Beispieldatensätzen. Der Funktionsweise von Algorithmen der Parsimonie-Rekonstruktion sowie der Einarbeitung in entsprechende Software wird vertieft behandelt, ebenso die Evaluierung von Stammbaumhypothesen (Resampling-Techniken). Thematisiert werden Partitionierung und Kombination von Matrices, wobei anhand unterschiedlicher Beispieldatensätze das phylogenetische Signal unterschiedlicher Genomabschnitte und Kompartimente (Pflanzen) untersucht wird. Parsimonie-Hypothesen werden dann Modellbasierten Stammbaumhypothesen gegenübergestellt. Ein weiterer Abschnitt widmet sich der grafischen Darstellung von Stammbäumen. Dazu kommt die Diskussion klassischer und aktueller Arbeiten aus wissenschaftlichen Zeitschriften, um den Studierenden die aktuelle Entwicklungen in der molekularen Phylogenetik zu vermitteln. Der Kurs zielt vornehmlich auf ein Kennenlernen von Methoden und aktuellen Computerprogrammen für die Stammbaumrekonstruktion, -evaluierung und präsentation. Es ist zu empfehlen das Modul Einführung in die molekulare Phylogenetik (No. 13) als Vorbereitung zu besuchen. close