19401601 Vorlesung

SoSe 18: Sequenzanalyse

Knut Reinert

Zusätzl. Angaben / Voraussetzungen

Wahlpflichtveranstaltung für Studenten im Masterstudiengang Bioinformatik

Kommentar

Ziele:

Die Studentinnen und Studenten erlangen ein tieferes Versta¨ndnis fu¨r grundlegende algorithmische Konzepte im Bereich der Analyse genomischer Sequenzen vor dem Hintergrund aktueller Forschungsrichtungen der Bioinformatik und Biotechnologie. Sie verstehen verschiedene Paradigmen zur approximativen Suche, sie wissen, unter welchen Voraussetzungen bestimmte Algorithmen anderen vorzuziehen sind, und ko¨nnen wissenschaftliche Publikationen auf dem Gebiet entsprechend einscha¨tzen.

Es werden vertieft Themen aus beispielsweise folgenden Gebieten behandelt:

  • Paradigmen fu¨r approximative, semiglobale Alignments (read mapping)
  • Methoden zur Genomassemblierung und Metagenomassemblierung
  • Methoden zum Bestimmen genetischer Variationen (SNVs, SNPs, CNVs)
  • Algorithmische Probleme bei der Quantifizierung mit Hilfe von NGS Daten

Alle weiteren Informationen im KVV: https://kvv.imp.fu-berlin.de/portal/

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13 Termine

Regelmäßige Termine der Lehrveranstaltung

Di, 17.04.2018 10:00 - 12:00

Dozenten:
Univ.-Prof. Dr. Knut Reinert

Räume:
A3/SR 210 Seminarraum (Arnimallee 3-5)

Di, 24.04.2018 10:00 - 12:00

Dozenten:
Univ.-Prof. Dr. Knut Reinert

Räume:
A3/SR 210 Seminarraum (Arnimallee 3-5)

Di, 08.05.2018 10:00 - 12:00

Dozenten:
Univ.-Prof. Dr. Knut Reinert

Räume:
A3/SR 210 Seminarraum (Arnimallee 3-5)

Di, 15.05.2018 10:00 - 12:00

Dozenten:
Univ.-Prof. Dr. Knut Reinert

Räume:
A3/SR 210 Seminarraum (Arnimallee 3-5)

Di, 22.05.2018 10:00 - 12:00

Dozenten:
Univ.-Prof. Dr. Knut Reinert

Räume:
A3/SR 210 Seminarraum (Arnimallee 3-5)

Di, 29.05.2018 10:00 - 12:00

Dozenten:
Univ.-Prof. Dr. Knut Reinert

Räume:
A3/SR 210 Seminarraum (Arnimallee 3-5)

Di, 05.06.2018 10:00 - 12:00

Dozenten:
Univ.-Prof. Dr. Knut Reinert

Räume:
A3/SR 210 Seminarraum (Arnimallee 3-5)

Di, 12.06.2018 10:00 - 12:00

Dozenten:
Univ.-Prof. Dr. Knut Reinert

Räume:
A3/SR 210 Seminarraum (Arnimallee 3-5)

Di, 19.06.2018 10:00 - 12:00

Dozenten:
Univ.-Prof. Dr. Knut Reinert

Räume:
A3/SR 210 Seminarraum (Arnimallee 3-5)

Di, 26.06.2018 10:00 - 12:00

Dozenten:
Univ.-Prof. Dr. Knut Reinert

Räume:
A3/SR 210 Seminarraum (Arnimallee 3-5)

Di, 03.07.2018 10:00 - 12:00

Dozenten:
Univ.-Prof. Dr. Knut Reinert

Räume:
A3/SR 210 Seminarraum (Arnimallee 3-5)

Di, 10.07.2018 10:00 - 12:00

Dozenten:
Univ.-Prof. Dr. Knut Reinert

Räume:
A3/SR 210 Seminarraum (Arnimallee 3-5)

Di, 17.07.2018 10:00 - 12:00

Dozenten:
Univ.-Prof. Dr. Knut Reinert

Räume:
A3/SR 210 Seminarraum (Arnimallee 3-5)

Studienfächer A-Z