216403b
Laboratory Course
SoSe 18: Protein Analysis and Microsequencing / Proteinanalytik und Mikrosequenzierung
Christoph Weise, Werner Schröder
Information for students
ACHTUNG: Studierende können sich im CM nicht für diese Lehrveranstaltung anmelden. Die Anmeldung erfolgt nach der Platzvergabe durch das Studienbüro Chemie und Biochemie
Additional information / Pre-requisites
Seminar und Praktikum (216403a und b) können gewählt werden:
Das Seminar 216403a kann im Modul "Spezielle Aspekte der Molekularbiologie" zusammen mit einem anderen Seminar gewählt werden. close
- im Hautpstudium Biochemie (5 SWS);
- im Master Biochemie im Methodenmodul "Spezielle Methoden der Molekularbiologie (5 LP)".
Das Seminar 216403a kann im Modul "Spezielle Aspekte der Molekularbiologie" zusammen mit einem anderen Seminar gewählt werden. close
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Inhalt / contents
lectures: advanced methods in protein sequence analysis
Dr. C. Weise: chris.weise@biochemie.fu-berlin.de
Dr. W. Schröder: WernerSchroe@zedat.fu-berlin.de close
- Protein separation by 1D and 2D-PAGE
- Electro-blotting of proteins onto PVDF membrane
- Electro-elution and crush-and-soak extraction of proteins from gels
- Generation of peptides by enzymatic and chemical cleavage (in solution, in gel and on membrane)
- Derivatization and identification of cysteine and phosphoserine residues in proteins
- Performic acid oxidation
- Amino-acid analysis (total acid hydrolysis of proteins)
- Peptide separation by RP-HPLC
- Desalting of proteins and peptides by HPLC and SEC
- Manual N-terminal sequencing of proteins (PITC, ladder sequencing)
- Mass-spectrometric analysis of proteins and peptides
- Database search concerning protein identification and homology
- Sequence analysis (secondary structure prediction, Chou & Fasman, and hydropathy plot, Kyte & Doolittle)
- Automatic synthesis of DNA and RNA oligomers and their purification by HPLC and gel electrophoresis
lectures: advanced methods in protein sequence analysis
Dr. C. Weise: chris.weise@biochemie.fu-berlin.de
Dr. W. Schröder: WernerSchroe@zedat.fu-berlin.de close