216201b
Seminar
SoSe 20: Spezielle Aspekte der Röntgenstrukturanalyse
Oliver Daumke, Christian Feiler, Bernhard Loll, Manfred Weiss
Hinweise für Studierende
Da aus aktuellem Anlass momentan keine Präsenzlehrveranstaltungen erlaubt sind, findet diese Lehrveranstaltung vorerst nicht statt. Sie wird stattfinden, wenn Kurse, die eine Teilnahme erfordern, wieder erlaubt sind.
This course cannot take place at the moment, as any courses that require attendance are prohibited. It will take place, when courses that require attendance are permitted again.
Das gesamte Methodenmodul wird sobald wie möglich ein zusätzliches Mal angeboten, inklusives dieses Seminars. Teilmodul des Methodenkurses "Grundlagen der Strukturbiochemie" Schließen
This course cannot take place at the moment, as any courses that require attendance are prohibited. It will take place, when courses that require attendance are permitted again.
Das gesamte Methodenmodul wird sobald wie möglich ein zusätzliches Mal angeboten, inklusives dieses Seminars. Teilmodul des Methodenkurses "Grundlagen der Strukturbiochemie" Schließen
Zusätzl. Angaben / Voraussetzungen
In der Zeit vom 25.05 - 29.05.20 am HZB/BESSSY und vom 08.06 - 11.06.20 am MDC.
Genaue Termine und Orte (HZB/BESSSY und MDC) auf Anfrage (wird von jeder der beteiligten Gruppen individuell organisiert und richtet sich flexibel nach dem Verlauf der Versuche).
Hinweis: Abschlussseminar zu 216201a-c: 12.06.20, 9:00 bis 12:00 Uhr, Takustr. 6, room 323 (Wahl group))
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Genaue Termine und Orte (HZB/BESSSY und MDC) auf Anfrage (wird von jeder der beteiligten Gruppen individuell organisiert und richtet sich flexibel nach dem Verlauf der Versuche).
Hinweis: Abschlussseminar zu 216201a-c: 12.06.20, 9:00 bis 12:00 Uhr, Takustr. 6, room 323 (Wahl group))
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Kommentar
Methodenmodul: Grundlagen der Strukturbiochemie
Hochschule/Fachbereich/Institut: Freie Universität Berlin/Fachbereich Biologie, Chemie, Pharmazie/Institut für Chemie und Biochemie
Modulverantwortliche/r: Dozentinnen oder Dozenten des Moduls
Zugangsvoraussetzungen: keine
Qualifikationsziele: Die Studentinnen und Studenten lernen Verfahren für die Präparation von biologischen Makromolekülen und für die Strukturanalyse kennen. Sie eignen sich theoretische Grundlagen zu Verfahren der makromolekularen Strukturanalyse an. Die Studentinnen und Studenten können makromolekulare Eigenschaften, die für die Strukturanalyse eine Rolle spielen, beurteilen. Sie können Manuskripte, in denen makromolekulare Strukturen und Strukturanalysen beschrieben werden, kritisch erfassen und die Qualität von makromolekularen Strukturen beurteilen. Inhalte: Herstellung einer Probe eines biologischen Makromoleküls für die Strukturanalyse; Bioinformatische, biochemische oder biophysikalische Charakterisierung eines biologischen Makromoleküls; Durchführung eines oder mehrerer Verfahren zur Strukturanalyse; Strukturbeschreibung und graphische Darstellung von Strukturen; Präsentation strukturbiologischer Experimente und Ergebnisse.
Inhalt des Seminars:
Dr.C. Feiler: christian.feiler@helmholtz-berlin.de
Dr. M. Weiss: manfred.weiss@helmholtz-berlin.de
Prof. Dr. O. Daumke: oliver.daumke@mdc-berlin.de
Dr. B. Loll: Loll@chemie.fu-berlin.de Schließen
Hochschule/Fachbereich/Institut: Freie Universität Berlin/Fachbereich Biologie, Chemie, Pharmazie/Institut für Chemie und Biochemie
Modulverantwortliche/r: Dozentinnen oder Dozenten des Moduls
Zugangsvoraussetzungen: keine
Qualifikationsziele: Die Studentinnen und Studenten lernen Verfahren für die Präparation von biologischen Makromolekülen und für die Strukturanalyse kennen. Sie eignen sich theoretische Grundlagen zu Verfahren der makromolekularen Strukturanalyse an. Die Studentinnen und Studenten können makromolekulare Eigenschaften, die für die Strukturanalyse eine Rolle spielen, beurteilen. Sie können Manuskripte, in denen makromolekulare Strukturen und Strukturanalysen beschrieben werden, kritisch erfassen und die Qualität von makromolekularen Strukturen beurteilen. Inhalte: Herstellung einer Probe eines biologischen Makromoleküls für die Strukturanalyse; Bioinformatische, biochemische oder biophysikalische Charakterisierung eines biologischen Makromoleküls; Durchführung eines oder mehrerer Verfahren zur Strukturanalyse; Strukturbeschreibung und graphische Darstellung von Strukturen; Präsentation strukturbiologischer Experimente und Ergebnisse.
Inhalt des Seminars:
- Synchrotron radiation
- Linux and vi
- Data collection strategies
- Data processing using XDS and XDSAPP
- Data quality indicators
- Structure solution
- Refinement
- Electron density
- Model building
- Structure validation
Dr.C. Feiler: christian.feiler@helmholtz-berlin.de
Dr. M. Weiss: manfred.weiss@helmholtz-berlin.de
Prof. Dr. O. Daumke: oliver.daumke@mdc-berlin.de
Dr. B. Loll: Loll@chemie.fu-berlin.de Schließen