216201b
Seminar
SoSe 20: Advanced X-Ray Crystallography
Oliver Daumke, Christian Feiler, Bernhard Loll, Manfred Weiss
Information for students
Da aus aktuellem Anlass momentan keine Präsenzlehrveranstaltungen erlaubt sind, findet diese Lehrveranstaltung vorerst nicht statt. Sie wird stattfinden, wenn Kurse, die eine Teilnahme erfordern, wieder erlaubt sind.
This course cannot take place at the moment, as any courses that require attendance are prohibited. It will take place, when courses that require attendance are permitted again.
Partial module of the methods course “Biomolecular X-ray crystallography”. The entire methods module (including this seminar part) will be offered again as soon as possible close
This course cannot take place at the moment, as any courses that require attendance are prohibited. It will take place, when courses that require attendance are permitted again.
Partial module of the methods course “Biomolecular X-ray crystallography”. The entire methods module (including this seminar part) will be offered again as soon as possible close
Additional information / Pre-requisites
The course will take place at the HZB/Bessy from 25.05-29.05.20 and at the MDC from 08.06-11.06.20.
The exact dates and places (HZB/BESSY and MDC) upon request (both are planned individual from each group and are dependant on the process of the experiments).
Final seminar for 216201 a-c Schedule: 12.06.20, 9:00 bis 12:00 h Location: Takustr. 6, SR 323, Wahl group
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The exact dates and places (HZB/BESSY and MDC) upon request (both are planned individual from each group and are dependant on the process of the experiments).
Final seminar for 216201 a-c Schedule: 12.06.20, 9:00 bis 12:00 h Location: Takustr. 6, SR 323, Wahl group
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Methodenmodul: Grundlagen der Strukturbiochemie
Hochschule/Fachbereich/Institut: Freie Universität Berlin/Fachbereich Biologie, Chemie, Pharmazie/Institut für Chemie und Biochemie
Modulverantwortliche/r: Dozentinnen oder Dozenten des Moduls
Zugangsvoraussetzungen: keine
Qualifikationsziele: Die Studentinnen und Studenten lernen Verfahren für die Präparation von biologischen Makromolekülen und für die Strukturanalyse kennen. Sie eignen sich theoretische Grundlagen zu Verfahren der makromolekularen Strukturanalyse an. Die Studentinnen und Studenten können makromolekulare Eigenschaften, die für die Strukturanalyse eine Rolle spielen, beurteilen. Sie können Manuskripte, in denen makromolekulare Strukturen und Strukturanalysen beschrieben werden, kritisch erfassen und die Qualität von makromolekularen Strukturen beurteilen. Inhalte: Herstellung einer Probe eines biologischen Makromoleküls für die Strukturanalyse; Bioinformatische, biochemische oder biophysikalische Charakterisierung eines biologischen Makromoleküls; Durchführung eines oder mehrerer Verfahren zur Strukturanalyse; Strukturbeschreibung und graphische Darstellung von Strukturen; Präsentation strukturbiologischer Experimente und Ergebnisse.
Inhalt des Seminars:
Dr.C. Feiler: christian.feiler@helmholtz-berlin.de
Dr. M. Weiss: manfred.weiss@helmholtz-berlin.de
Prof. Dr. O. Daumke: oliver.daumke@mdc-berlin.de
Dr. B. Loll: Loll@chemie.fu-berlin.de close
Hochschule/Fachbereich/Institut: Freie Universität Berlin/Fachbereich Biologie, Chemie, Pharmazie/Institut für Chemie und Biochemie
Modulverantwortliche/r: Dozentinnen oder Dozenten des Moduls
Zugangsvoraussetzungen: keine
Qualifikationsziele: Die Studentinnen und Studenten lernen Verfahren für die Präparation von biologischen Makromolekülen und für die Strukturanalyse kennen. Sie eignen sich theoretische Grundlagen zu Verfahren der makromolekularen Strukturanalyse an. Die Studentinnen und Studenten können makromolekulare Eigenschaften, die für die Strukturanalyse eine Rolle spielen, beurteilen. Sie können Manuskripte, in denen makromolekulare Strukturen und Strukturanalysen beschrieben werden, kritisch erfassen und die Qualität von makromolekularen Strukturen beurteilen. Inhalte: Herstellung einer Probe eines biologischen Makromoleküls für die Strukturanalyse; Bioinformatische, biochemische oder biophysikalische Charakterisierung eines biologischen Makromoleküls; Durchführung eines oder mehrerer Verfahren zur Strukturanalyse; Strukturbeschreibung und graphische Darstellung von Strukturen; Präsentation strukturbiologischer Experimente und Ergebnisse.
Inhalt des Seminars:
- Synchrotron radiation
- Linux and vi
- Data collection strategies
- Data processing using XDS and XDSAPP
- Data quality indicators
- Structure solution
- Refinement
- Electron density
- Model building
- Structure validation
Dr.C. Feiler: christian.feiler@helmholtz-berlin.de
Dr. M. Weiss: manfred.weiss@helmholtz-berlin.de
Prof. Dr. O. Daumke: oliver.daumke@mdc-berlin.de
Dr. B. Loll: Loll@chemie.fu-berlin.de close