19405301
Vorlesung
SoSe 22: Advanced Algorithms in Bioinformatics
Knut Reinert
Kommentar
Ziele:
Die Studentinnen und Studenten erlangen ein tieferes Verständnis für grundlegende algorithmische Konzepte im Bereich der Analyse genomischer Sequenzen vor dem Hintergrund aktueller Forschungsrichtungen der Bioinformatik und Biotechnologie. Sie verstehen verschiedene Paradigmen zur approximativen Suche, sie wissen, unter welchen Voraussetzungen bestimmte Algorithmen anderen vorzuziehen sind, und können wissenschaftliche Publikationen auf dem Gebiet entsprechend einschätzen.
Es werden vertieft Themen aus beispielsweise folgenden Gebieten behandelt:
- Paradigmen für approximative, semiglobale Alignments (read mapping)
- Methoden zur Genomassemblierung und Metagenomassemblierung
- Methoden zum Bestimmen genetischer Variationen (SNVs, SNPs, CNVs)
- Algorithmische Probleme bei der Quantifizierung mit Hilfe von NGS Daten
Alle weiteren Informationen im Whiteboard: https://mycampus.imp.fu-berlin.de/portal
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Regelmäßige Termine der Lehrveranstaltung
Di, 19.04.2022 10:00 - 12:00
Advanced Algorithms in Bioinformatics
Di, 26.04.2022 10:00 - 12:00
Advanced Algorithms in Bioinformatics
Di, 03.05.2022 10:00 - 12:00
Advanced Algorithms in Bioinformatics
Di, 10.05.2022 10:00 - 12:00
Advanced Algorithms in Bioinformatics
Di, 17.05.2022 10:00 - 12:00
Advanced Algorithms in Bioinformatics
Di, 24.05.2022 10:00 - 12:00
Advanced Algorithms in Bioinformatics
Di, 31.05.2022 10:00 - 12:00
Advanced Algorithms in Bioinformatics
Di, 07.06.2022 10:00 - 12:00
Advanced Algorithms in Bioinformatics
Di, 14.06.2022 10:00 - 12:00
Advanced Algorithms in Bioinformatics
Di, 21.06.2022 10:00 - 12:00
Advanced Algorithms in Bioinformatics
Di, 28.06.2022 10:00 - 12:00
Advanced Algorithms in Bioinformatics
Di, 05.07.2022 10:00 - 12:00
Advanced Algorithms in Bioinformatics
Di, 12.07.2022 10:00 - 12:00
Advanced Algorithms in Bioinformatics
Di, 19.07.2022 10:00 - 12:00
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