Inhalte: Ein kleines Forschungsprojekt mit aktueller Relevanz im Bereich der Moleküldynamik oder Stochastischer Simulation wird mit mathematischen, computergestützten oder physikalischen Hilfsmitteln bearbeitet. Die Prüfungsleistung besteht in der Regel aus: (1) Aufarbeitung des Themas anhand vorgegebener Literatur (typischerweise 1-3 Papers), (2) Implementierung oder theoretische Behandlung einer konkreten Problemstellung, (3) Dokumentation der Ergebnisse in einem Report und (4) Vorstellung der Ergebnisse in einem Vortrag. Die Bearbeitung erfolgt semesterbegleitend. Es finden regelmäßige Treffen mit dem Betreuer des Projektes statt. Beurteilt wird die Qualität der Ausarbeitung und der Präsentation. Beispiele für Projektbereiche sind:

• Spezielle Aspekte bei der Moleküldynamik-Simulation
• Raumzeichliche stochastischen Simulation in der Systembiologie
• Optimierungsprobleme im Bereich der molekularen Modellierung
• Markov-Modellierung einer Moleküldynamik-Simulation
• Fehlerrechnung bei der Markov-Modellierung
• Variationsrechnung in der Konformationsdynamik
• Theorie der Übergangspfade in dynamischen Systemen

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