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Vorlesung
WiSe 18/19: V Genetik und Genomforschung (V)
Katja Nowick, Michael Grünstäudl
Hinweise für Studierende
Vorbesprechung am 1. Vorlesungstag (17.10.2018)
Kommentar
Ein Überblick über den Aufbau der Lehrveranstaltung (d.h. Vorlesung und Übung) wird im Rahmen der ersten Vorlesung gegeben.
Behandelte Themen (Teil Nowick):
1. Genregulation: Dogma der Molekularbiologie, Transkription, Translation, Transkriptionsfaktoren und deren Bindungsmotive
2. Nicht-kodierende RNAs: Strukturen, Funktionen
3. Genregulatorische Netzwerke: Komplexitaet der Genregulation, Analysemethoden
4. Alignments: paarweise Alignments, multiple Alignments
5. Populationsgenetik: Vererbungsmuster und Erbkrankheiten, Mutation, Selektion, Hardy-Weinberg-Gleichgewicht, Neutrale Theory, Molekulare Uhr, Linkage Disequilibrium, Tests fuer positive Selektion in Populationen
6. Phylogenetik: Baeume (rooted/unrooted), Neighbor joining, Maximum Parsimony, Maximum Likeliood, Tests fuer positive Selektion, Genomprojekte
Behandelte Themen (Teil Grünstäudl):
Vorlesung 1: Prinzipien der Evolution, Ähnlichkeit mit genetischen Algorithmen, Genomtypen einer Zelle (nukleäres, mitochondriales und chloroplastisches Genom)
Vorlesung 2: Aufbau und Struktur des nukleären Genoms, Aufbau und Struktur von Chromosomen, Modifikation von Histonen
Vorlesung 3: Funktion chromosomaler Strukturelemente (Replikationsursprung, Zentromer, Telomer), Steuerung des Zellzyklus
Vorlesung 4: Methoden der Chromosomenanalyse (Karyogramm, FISH, GISH), Chromosomenanomalien (Translokationen, Duplikationen, Deletionen)
Vorlesung 5: Aufbau und Struktur des mitochondrialen und des chloroplastischen Genoms, Unterschiede zum nukleären Genom
Vorlesung 6: Genfamilien und Prinzip der Homologie bei Genen, Prinzipien der Phylogenetik und Phylogenomik
Vorlesung 7: Arten der Genomsequenzierung, Next-Generation Sequencing (Illumina, PacBio), Genome Assembly, Genome Annotation
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Behandelte Themen (Teil Nowick):
1. Genregulation: Dogma der Molekularbiologie, Transkription, Translation, Transkriptionsfaktoren und deren Bindungsmotive
2. Nicht-kodierende RNAs: Strukturen, Funktionen
3. Genregulatorische Netzwerke: Komplexitaet der Genregulation, Analysemethoden
4. Alignments: paarweise Alignments, multiple Alignments
5. Populationsgenetik: Vererbungsmuster und Erbkrankheiten, Mutation, Selektion, Hardy-Weinberg-Gleichgewicht, Neutrale Theory, Molekulare Uhr, Linkage Disequilibrium, Tests fuer positive Selektion in Populationen
6. Phylogenetik: Baeume (rooted/unrooted), Neighbor joining, Maximum Parsimony, Maximum Likeliood, Tests fuer positive Selektion, Genomprojekte
Behandelte Themen (Teil Grünstäudl):
Vorlesung 1: Prinzipien der Evolution, Ähnlichkeit mit genetischen Algorithmen, Genomtypen einer Zelle (nukleäres, mitochondriales und chloroplastisches Genom)
Vorlesung 2: Aufbau und Struktur des nukleären Genoms, Aufbau und Struktur von Chromosomen, Modifikation von Histonen
Vorlesung 3: Funktion chromosomaler Strukturelemente (Replikationsursprung, Zentromer, Telomer), Steuerung des Zellzyklus
Vorlesung 4: Methoden der Chromosomenanalyse (Karyogramm, FISH, GISH), Chromosomenanomalien (Translokationen, Duplikationen, Deletionen)
Vorlesung 5: Aufbau und Struktur des mitochondrialen und des chloroplastischen Genoms, Unterschiede zum nukleären Genom
Vorlesung 6: Genfamilien und Prinzip der Homologie bei Genen, Prinzipien der Phylogenetik und Phylogenomik
Vorlesung 7: Arten der Genomsequenzierung, Next-Generation Sequencing (Illumina, PacBio), Genome Assembly, Genome Annotation
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