23771a
Lecture
WiSe 19/20: V Genetik und Genomforschung (V)
Katja Nowick, Michael Grünstäudl
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Vorbesprechung am 1. Vorlesungstag (16.10.2019)
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Ein Überblick über den Aufbau der Lehrveranstaltung (d.h. Vorlesung und Übung) wird im Rahmen der ersten Vorlesung gegeben.
Behandelte Themen (Teil Nowick):
1. Genregulation: Dogma der Molekularbiologie, Transkription, Translation, Transkriptionsfaktoren und deren Bindungsmotive
2. Nicht-kodierende RNAs: Strukturen, Funktionen
3. Genregulatorische Netzwerke: Komplexitaet der Genregulation, Analysemethoden
4. Alignments: paarweise Alignments, multiple Alignments
5. Populationsgenetik: Vererbungsmuster und Erbkrankheiten, Mutation, Selektion, Hardy-Weinberg-Gleichgewicht, Neutrale Theory, Molekulare Uhr, Linkage Disequilibrium, Tests fuer positive Selektion in Populationen
6. Phylogenetik: Baeume (rooted/unrooted), Neighbor joining, Maximum Parsimony, Maximum Likeliood, Tests fuer positive Selektion, Genomprojekte
Behandelte Themen (Teil Grünstäudl):
Vorlesung 1: Prinzipien der Evolution, Ähnlichkeit mit genetischen Algorithmen, Genomtypen einer Zelle (nukleäres, mitochondriales und chloroplastisches Genom)
Vorlesung 2: Aufbau und Struktur des nukleären Genoms, Aufbau und Struktur von Chromosomen, Modifikation von Histonen
Vorlesung 3: Funktion chromosomaler Strukturelemente (Replikationsursprung, Zentromer, Telomer), Steuerung des Zellzyklus
Vorlesung 4: Methoden der Chromosomenanalyse (Karyogramm, FISH, GISH), Chromosomenanomalien (Translokationen, Duplikationen, Deletionen)
Vorlesung 5: Aufbau und Struktur des mitochondrialen und des chloroplastischen Genoms, Unterschiede zum nukleären Genom
Vorlesung 6: Genfamilien und Prinzip der Homologie bei Genen, Prinzipien der Phylogenetik und Phylogenomik
Vorlesung 7: Arten der Genomsequenzierung, Next-Generation Sequencing (Illumina, PacBio), Genome Assembly, Genome Annotation
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Behandelte Themen (Teil Nowick):
1. Genregulation: Dogma der Molekularbiologie, Transkription, Translation, Transkriptionsfaktoren und deren Bindungsmotive
2. Nicht-kodierende RNAs: Strukturen, Funktionen
3. Genregulatorische Netzwerke: Komplexitaet der Genregulation, Analysemethoden
4. Alignments: paarweise Alignments, multiple Alignments
5. Populationsgenetik: Vererbungsmuster und Erbkrankheiten, Mutation, Selektion, Hardy-Weinberg-Gleichgewicht, Neutrale Theory, Molekulare Uhr, Linkage Disequilibrium, Tests fuer positive Selektion in Populationen
6. Phylogenetik: Baeume (rooted/unrooted), Neighbor joining, Maximum Parsimony, Maximum Likeliood, Tests fuer positive Selektion, Genomprojekte
Behandelte Themen (Teil Grünstäudl):
Vorlesung 1: Prinzipien der Evolution, Ähnlichkeit mit genetischen Algorithmen, Genomtypen einer Zelle (nukleäres, mitochondriales und chloroplastisches Genom)
Vorlesung 2: Aufbau und Struktur des nukleären Genoms, Aufbau und Struktur von Chromosomen, Modifikation von Histonen
Vorlesung 3: Funktion chromosomaler Strukturelemente (Replikationsursprung, Zentromer, Telomer), Steuerung des Zellzyklus
Vorlesung 4: Methoden der Chromosomenanalyse (Karyogramm, FISH, GISH), Chromosomenanomalien (Translokationen, Duplikationen, Deletionen)
Vorlesung 5: Aufbau und Struktur des mitochondrialen und des chloroplastischen Genoms, Unterschiede zum nukleären Genom
Vorlesung 6: Genfamilien und Prinzip der Homologie bei Genen, Prinzipien der Phylogenetik und Phylogenomik
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