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Seminar
WiSe 21/22: Einführung in die Epigenomik
Alexander Meissner
Hinweise für Studierende
Seminar ist ausschließlich in Englisch.
Die Anmeldung zur Teilnahme an dem virtuellen Seminar sollte per Email an office-meissner@molgen.mpg.de bis spätestens 16. Dezember 2021 erfolgen. Die Zugangsdaten erhalten Sie dann nach der Anmeldung per Email kurz vor Beginn des Seminars.
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Kommentar
Inhalt:
Chemische Modifikationen an DNA- und Histonproteinen bilden ein komplexes regulatorisches Netzwerk, das die Chromatinstruktur und die Genomfunktion moduliert. Das Epigenom bezieht sich auf die vollständige Beschreibung dieser potenziell vererbbaren Veränderungen im gesamten Genom. Die Zusammensetzung des Epigenoms innerhalb einer bestimmten Zelle ist eine Funktion der genetischen Determinanten, der Abstammungslinie und der Umgebung. Nachdem die Sequenzierung des menschlichen Genoms abgeschlossen ist, versuchen Forscher nun einen umfassenden Überblick über die epigenetischen Veränderungen zu bekommen, die bestimmen, wie sich genetische Informationen vor einem unglaublich unterschiedlichen Hintergrund von Entwicklungsstadien, Gewebetypen und Krankheitszuständen manifestieren.
Ziel des Seminars ist es, eine Einführung in die Epigenetik zu geben, einschließlich eines Überblicks und eines grundlegenden Verständnisses der Schlüsseltechnologien, die die heutigen epigenomischen Daten erzeugen. Am zweiten Tag wird die entsprechende Datenverarbeitung und -analyse behandelt.
Donnerstag:
Einführung in die Epigenetik
Einführung in die Next-Generation Sequenzierung
Schlüsseltechnologien: DNA-Mapping, Chromatin-Mapping, 3D-Architektur, Long-Read Sequenzierung
Isolierung von DNA mit hohem Molekulargewicht (für Long-Read Sequenzierung), Erzeugung von Bibliotheken auf dem neuesten Stand der Technik und Qualitätskontrolle, Sequenzierung
Freitag:
Vom DNA-Sequenzer zur Datenanalyse
Nanopore-Sequenzierung und -Analyse
(Epi) Genom-Browsing
Epigenetische Deregulierung bei Krankheiten
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