216201c Laborpraktikum

SoSe 20: Strukturaufklärung von Biomolekülen durch Röntgenkristallographie

Oliver Daumke, Christian Feiler, Bernhard Loll, Markus Wahl, Manfred Weiss

Hinweise für Studierende

Das gesamte Methodenmodul wird sobald wie möglich ein zusätzliches Mal angeboten. Da aus aktuellem Anlass momentan keine Präsenzlehrveranstaltungen erlaubt sind, finden Praktika vorerst nicht statt. Sie werden wieder stattfinden, wenn Kurse, die eine Teilnahme erfordern, wieder erlaubt sind.  
The lab courses cannot take place at the moment, as any courses that require attendance are prohibited. They will take place, when courses that require attendance are permitted again.

Teilmodul des Methodenkurses "Grundlagen der Strukturbiochemie" Schließen

Zusätzl. Angaben / Voraussetzungen

Weitere Angaben zum Praktikum:

Teil 1: Wahl, Loll
Termin: 04.05. - 15.05.20
Ort: Takustr. 6, 3. OG, AG Wahl Laborräume

Teil 2: Feiler, Weiss
Wichtiger Hinweis: Schwangeren und stillenden Frauen ist aufgrund der Strahlenschutzbestimmungen das Arbeiten am Speicherring (Teil 2) untersagt.
Termin: 25.05. - 29.05.20, Treffpunkt um 10:00 Uhr beim Pförtner
Ort: c/o Soft Matter and Functional Materials, Elektronenspeicherring BESSY II, Albert-Einstein-Str. 15, 12489 Berlin, Adlershof

Teil 3: Daumke
Termin: 08.06. - 11.06.20
Ort: MDC für Molekulare Medizin, Robert-Rössle-Str. 10. 13125 Berlin (Buch), Seminar: MDC.C (Haus 83). Dendrit 2; Praktikum: Haus 31.2, Raum 0248 (AG Heinemann) (s.Vorlesungsverzeichnis)

Hinweis: Abschlussseminar zu 216201a-c: 12.06.20, 9:00 bis 12:00 Uhr, Takustr. 6, room 323 (Wahl group))

Platzvergabe: Di., 14.04.20, 9:00 Uhr, Thielallee 63, room 230 (lecture hall; Lise-Meitner-Hörsaal) Schließen

Kommentar

Methodenmodul: Grundlagen der Strukturbiochemie
Hochschule/Fachbereich/Institut: Freie Universität Berlin/Fachbereich Biologie, Chemie, Pharmazie/Institut für Chemie und Biochemie
Modulverantwortliche/r: Dozentinnen oder Dozenten des Moduls
Zugangsvoraussetzungen: keine
Qualifikationsziele: Die Studentinnen und Studenten lernen Verfahren für die Präparation von biologischen Makromolekülen und für die Strukturanalyse kennen. Sie eignen sich theoretische Grundlagen zu Verfahren der makromolekularen Strukturanalyse an. Die Studentinnen und Studenten können makromolekulare Eigenschaften, die für die Strukturanalyse eine Rolle spielen, beurteilen. Sie können Manuskripte, in denen makromolekulare Strukturen und Strukturanalysen beschrieben werden, kritisch erfassen und die Qualität von makromolekularen Strukturen beurteilen. Inhalte: Herstellung einer Probe eines biologischen Makromoleküls für die Strukturanalyse; Bioinformatische, biochemische oder biophysikalische Charakterisierung eines biologischen Makromoleküls; Durchführung eines oder mehrerer Verfahren zur Strukturanalyse; Strukturbeschreibung und graphische Darstellung von Strukturen; Präsentation strukturbiologischer Experimente und Ergebnisse.
Inhalte des Praktikums:
  • In silico characterization of a target protein
  • Recombinant protein production and purification
  • Limited proteolysis
  • Biochemical and biophysical characterization of target protein (ITC, Thermofluor, CD spectroscopy)
  • Crystallization, crystal harvesting and cryo-protection
  • Derivatization of protein crystals
  • X-ray diffraction data collection at a synchrotron source
  • Data reduction
  • Structure determination (MAD, SIRAS and molecular replacement)
  • Interpretation of electron density maps and model building
  • Refinement and validation
  • Structure analysis and preparation of structure figures


Prof. Dr. M. Wahl: mwahl@zedat.fu-berlin.de
Dr. B. Loll: loll@chemie.fu-berlin.de

Dr. C. Feiler: christian.feiler@helmholtz-berlin.de
Dr. M. Weiss: manfred.weiss@helmholtz-berlin.de

Prof. Dr. O. Daumke: oliver.daumke@mdc-berlin.de Schließen

Studienfächer A-Z