216502a
Vorlesung
SoSe 20: Makromolekulare (protein-protein, protein-DNA/RNA) Interaktionen
Sutapa Chakrabarti
Hinweise für Studierende
Vertonte ppt und/oder Videokonferenz zur regulären Zeit.
Die Teilnehmerzahl ist dieses Semester auf 25 Leute begrenzt.
Bitten melden Sie sich für dieses Modul über Campus Management an und
schicken bitte gleichzeitig ein Email an die Dozentin
(chakraba@zedat.fu-berlin.de)
Weitere Informationen werden in Blackboard veröffentlicht.
Diese Veranstaltung wird nur dann stattfinden, wenn mindenstens sechs Studierende am Tag vor dem ersten Termin angemeldet sind.
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Diese Veranstaltung wird nur dann stattfinden, wenn mindenstens sechs Studierende am Tag vor dem ersten Termin angemeldet sind.
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Kommentar
Inhalt / Content:
Prof. Dr. Sutapa Chakrabarti: chakraba@zedat.fu-berlin.de Schließen
- Thermodynamic and kinetic definitions of macromolecular interactions
- Biochemical methods of determining protein-protein interactions (co-precipitation, size-exclusion analysis, cross-linking mass spectrometry, TAP, FRET, yeast 2-hybrid, proximity-dependent biotin identification)
- Biochemical methods of determining protein nucleic acid interactions (gel-shift assay, protection/foot-printing assays, yeast 3-hybrid)
- Biophysical methods of analysing protein-protein/protein-nucleic acid interactions (analytical ultra-centrifugation, light scattering, isothermal titration calorimetry, surface plasmon resonance, fluorescent anisotropy, microscale thermophoresis)
- Presentation and interpretation of biochemical and biophysical data
- High throughput methods of analysis protein-nucleic acid interactions (micro-array technology, next-generation sequencing based methods such as CLIP and its variations, CRAC, Hits-FLIP and adaptation of classical methods such as SELEX and ChIP to high throughput techniques.
- High throughput methods of analysing protein-protein interactions (computational methods as well as proteomics-based approaches)
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