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Lecture
WiSe 12/13: Simulation von Biomolekülen
Burkhard Schmidt;Konstantin Fackeldey;Marcus Weber
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Inhalt In der modernen (Bio-)Chemie sind Simulationen zur Struktur und Dynamik von Biomolekülen ein unverzichtbares Werkzeug geworden und damit fast gleichberechtigt neben Experimente getreten. Die angekündigte Vorlesung hat im wesentlichen drei Ziele:1. Die Studenten sollen die physikalisch/chemischen Grundlagen solcher Simulationen kennen lernen. Die zugrunde liegenden Annahmen sollen kritisch hinterfragt werden. 2. Die in der Simulation von Biomolekülen gebräuchlichsten numerischen Verfahren sollen erarbeitet werden, wobei das Hauptaugenmerk auf die Genauigkeit und Zuverlässigkeit gerichtet sein soll.3. Die sinnvolle Interpretation von Simulationsergebnissen soll anhand von Beispielen aus der aktuellen Forschung illustriert werden. Zielgruppe Master-Studierende im Vertiefungsmodul "Simulation molekularer und zellulärer Prozesse (A)" Literatur D. Frenkel, B. Smit, Understanding Molecular Simulation: From Algorithms to Applications, Academic Press, San Diego (2002) A. R. Leach, Molecular Modelling: Principles and Applications, Prentice Hall, Harlow (2001) T. Schlick, Molecular Modelling and Simulation. An Interdisciplinary Guide, Springer, Berlin/Heidelberg (2002) K. A. Dill and S. Bromberg, Molecular Driving Forces, Taylor and Francis, New York/London (2002) close
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