19700
Vorlesung
WiSe 13/14: Algorithmen und Datenstrukturen
Knut Reinert
Kommentar
ACHTUNG: Die Kommunikation für die Vorlesung wird in einem WiKi-Bereich stattfinden (siehe "Teaching" auf der der Webseite der AG Algorithmische Bioinformatik).
In der Vorlesung werden folgende Inhalte behandelt: Exaktes und approximatives String Matching, Dynamische Programmierung und Scoring Schemata, Endliche Automaten und formale Sprachen, paarweises und multiples Alignment, Multiples String Matching, Grundlagen von Markovketten und Hidden Markov Models, Algorithmen zur schnellen Suche in Sequenz-Datenbanken.
In den Übungen werden die erarbeiteten Inhalte vertieft und Analyse- und Beweistechniken eingeübt. Im Praktikum wird zunächst eine Einführung in Programmierwerkzeuge und die verwendete Pro-grammiersprache gegeben. Danach werden programmiertechnische Fertigkeiten anhand der in der Vorlesung besprochenen Algorithmen erklärt und vermittelt. Schließen
Literaturhinweise
Generelle Bücher:
Neil C. Jones, Pavel A. Pevzner: An Introduction to Bioinformatics Algorithms. MIT Press, Cambridge, MA, 2004. ISBN 0-262-10106-8
R. Durbin, S. Eddy, A. Krogh, G. Mitchison: Biological sequence analysis. Cambridge University Press, 1998. ISBN 0-521-62971-3
David B. Mount: Bioinformatics. Sequence and Genome Analysis. Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York, 2001. ISBN 0-87969-608-7
Chao, Zhang: Sequence comparison, Theory and Methods: Springer, ISBN: 978-1-85800-319-4
Mehr im Wiki (siehe "Teaching" auf der der Webseite der AG Algorithmische Bioinformatik). Schließen
16 Termine
Zusätzliche Termine
Do, 06.02.2014 14:00 - 16:00Review
Mi, 02.04.2014 14:00 - 16:00
Nachklausur AlDaBi
Regelmäßige Termine der Lehrveranstaltung
Do, 17.10.2013 14:00 - 16:00
Algorithmen und Datenstrukturen
Do, 24.10.2013 14:00 - 16:00
Algorithmen und Datenstrukturen
Do, 31.10.2013 14:00 - 16:00
Algorithmen und Datenstrukturen
Do, 07.11.2013 14:00 - 16:00
Algorithmen und Datenstrukturen
Do, 14.11.2013 14:00 - 16:00
Algorithmen und Datenstrukturen
Do, 21.11.2013 14:00 - 16:00
Algorithmen und Datenstrukturen
Do, 28.11.2013 14:00 - 16:00
Algorithmen und Datenstrukturen
Do, 05.12.2013 14:00 - 16:00
Algorithmen und Datenstrukturen
Do, 12.12.2013 14:00 - 16:00
Algorithmen und Datenstrukturen
Do, 19.12.2013 14:00 - 16:00
Algorithmen und Datenstrukturen
Do, 09.01.2014 14:00 - 16:00
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Do, 16.01.2014 14:00 - 16:00
Algorithmen und Datenstrukturen
Do, 23.01.2014 14:00 - 16:00
Algorithmen und Datenstrukturen
Do, 30.01.2014 14:00 - 16:00
Algorithmen und Datenstrukturen
Do, 06.02.2014 14:00 - 16:00
Algorithmen und Datenstrukturen
Do, 13.02.2014 14:00 - 16:00
Algorithmen und Datenstrukturen