Vorlesungsverzeichnis

WiSe 19/20  
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 19400001  
19400001 Vorlesung

WiSe 19/20: Algorithmen und Datenstrukturen

Knut Reinert

Kommentar

In der Vorlesung werden folgende Inhalte behandelt: Exaktes und approximatives String Matching, Dynamische Programmierung und Scoring Schemata, endliche Automaten und formale Sprachen, paarweises und multiples Alignment, multiples String Matching, Grundlagen von Markovketten und Hidden Markov Models, Algorithmen zur schnellen Suche in Sequenz-Datenbanken.

In den Übungen werden die erarbeiteten Inhalte vertieft und Analyse- und Beweistechniken eingeübt.

Das "Praktikum: Algorithmen und Datenstrukturen" (19401330) ist dieser Lehrveranstaltung angegliedert. Bitte informieren Sie sich auch auf der dortigen Seite!

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Literaturhinweise

Generelle Bücher/Basic reading:

  • Neil C. Jones, Pavel A. Pevzner: An Introduction to Bioinformatics Algorithms. MIT Press, Cambridge, MA, 2004. ISBN 0-262-10106-8
  • R. Durbin, S. Eddy, A. Krogh, G. Mitchison: Biological sequence analysis. Cambridge University Press, 1998. ISBN 0-521-62971-3
  • David B. Mount: Bioinformatics. Sequence and Genome Analysis. Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York, 2001. ISBN 0-87969-608-7
  • Chao, Zhang: Sequence comparison, Theory and Methods: Springer, ISBN: 978-1-85800-319-4
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15 Termine

Zusätzliche Termine

Fr, 06.12.2019 16:00 - 18:00
Review

Dozenten:
Prof. Dr.-Ing. Knut Reinert

Räume:
A3/Hs 001 Hörsaal (Arnimallee 3-5)

Mi, 30.09.2020 10:00 - 12:00
Nachklausur

Dozenten:
Prof. Dr.-Ing. Knut Reinert

Räume:
A3/Hs 001 Hörsaal (Arnimallee 3-5)

Regelmäßige Termine der Lehrveranstaltung

Do, 14:00 - 16:00 Algorithmen und Datenstrukturen 15 Termine
Do, 17.10.2019 14:00 - 16:00
Algorithmen und Datenstrukturen

Dozenten:
Prof. Dr.-Ing. Knut Reinert

Räume:
Hs B (Raum B.004, 100 Pl.) (Arnimallee 22)

Do, 24.10.2019 14:00 - 16:00
Algorithmen und Datenstrukturen

Dozenten:
Prof. Dr.-Ing. Knut Reinert

Räume:
Hs B (Raum B.004, 100 Pl.) (Arnimallee 22)

Do, 31.10.2019 14:00 - 16:00
Algorithmen und Datenstrukturen

Dozenten:
Prof. Dr.-Ing. Knut Reinert

Räume:
Hs B (Raum B.004, 100 Pl.) (Arnimallee 22)

Do, 07.11.2019 14:00 - 16:00
Algorithmen und Datenstrukturen

Dozenten:
Prof. Dr.-Ing. Knut Reinert

Räume:
Hs B (Raum B.004, 100 Pl.) (Arnimallee 22)

Do, 21.11.2019 14:00 - 16:00
Algorithmen und Datenstrukturen

Dozenten:
Prof. Dr.-Ing. Knut Reinert

Räume:
Hs B (Raum B.004, 100 Pl.) (Arnimallee 22)

Do, 28.11.2019 14:00 - 16:00
Algorithmen und Datenstrukturen

Dozenten:
Prof. Dr.-Ing. Knut Reinert

Räume:
Hs B (Raum B.004, 100 Pl.) (Arnimallee 22)

Do, 05.12.2019 14:00 - 16:00
Algorithmen und Datenstrukturen

Dozenten:
Prof. Dr.-Ing. Knut Reinert

Räume:
Hs B (Raum B.004, 100 Pl.) (Arnimallee 22)

Do, 12.12.2019 14:00 - 16:00
Algorithmen und Datenstrukturen

Dozenten:
Prof. Dr.-Ing. Knut Reinert

Räume:
Hs B (Raum B.004, 100 Pl.) (Arnimallee 22)

Do, 19.12.2019 14:00 - 16:00
Algorithmen und Datenstrukturen

Dozenten:
Prof. Dr.-Ing. Knut Reinert

Räume:
Hs B (Raum B.004, 100 Pl.) (Arnimallee 22)

Do, 09.01.2020 14:00 - 16:00
Algorithmen und Datenstrukturen

Dozenten:
Prof. Dr.-Ing. Knut Reinert

Räume:
Hs B (Raum B.004, 100 Pl.) (Arnimallee 22)

Do, 16.01.2020 14:00 - 16:00
Algorithmen und Datenstrukturen

Dozenten:
Prof. Dr.-Ing. Knut Reinert

Räume:
Hs B (Raum B.004, 100 Pl.) (Arnimallee 22)

Do, 23.01.2020 14:00 - 16:00
Algorithmen und Datenstrukturen

Dozenten:
Prof. Dr.-Ing. Knut Reinert

Räume:
Hs B (Raum B.004, 100 Pl.) (Arnimallee 22)

Do, 30.01.2020 14:00 - 16:00
Algorithmen und Datenstrukturen

Dozenten:
Prof. Dr.-Ing. Knut Reinert

Räume:
Hs B (Raum B.004, 100 Pl.) (Arnimallee 22)

Do, 06.02.2020 14:00 - 16:00
Algorithmen und Datenstrukturen

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Räume:
Hs B (Raum B.004, 100 Pl.) (Arnimallee 22)

Do, 13.02.2020 14:00 - 16:00
Algorithmen und Datenstrukturen

Dozenten:
Prof. Dr.-Ing. Knut Reinert

Räume:
Hs B (Raum B.004, 100 Pl.) (Arnimallee 22)

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Ort: Hs B Hörsaal/Arnim 22

Zeit: Do 14:00-16:00, zusätzliche Termine siehe LV-Details

Erster Termin: 17.10.2019

Unterrichtssprache: Deutsch

SWS: 2

Credits: 6 (für Austausch-studierende)

Teilnehmerzahl: 80

Platzbeschränkung: Ja

Teilnahmepflicht: Nein

Fachsemester: 3

Module zu dieser LV:
0260cA1.3
E61aA1.1

Studienfächer A-Z